| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4NCZ-CA-1 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✔ |
| 4NCZ-CA-2 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4NCZ-CA-3 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4NCZ-CA-4 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4NCZ-CA-5 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4NCZ-CA-6 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 7KBU-CA-1 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✔ |
| 1IVB-CA-1 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 4 | ✔ |
| 4IT5-CA-5 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 4 | 6 | 2 | ✘ |
| 4GJE-CA-1 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 4 | 6 | 2 | ✔ |
| 6DT0-CA-1 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 4 | ✔ |
| 4YGO-CA-1 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4YGO-CA-2 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4YGO-CA-7 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4YGO-CA-8 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4YGO-CA-11 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 4YGO-CA-12 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 5DA5-CA-1 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 4 | 7 | 2 | ✔ |
| 5DA5-CA-2 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 4 | 7 | 2 | ✔ |
| 5DA5-CA-3 | CA | Ca²⁺ | E4 | GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 4 | 7 | 2 | ✘ |