| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6TSP-CA-3 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.EDO.LEU. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✘ |
| 6TSP-CA-4 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.EDO.LEU. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✘ |
| 5MU9-CA-3 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.E64.HOH.LEU. | ✔ | 4 | 6 | 2 | ✔ |
| 5MU9-CA-4 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.E64.HOH.LEU. | ✔ | 4 | 6 | 2 | ✘ |
| 6TSN-CA-3 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.LEU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✔ |
| 6TSN-CA-4 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.LEU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 6TSO-CA-3 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.EDO.HOH.LEU. | ✔ | 4 | 6 | 2 | ✘ |
| 6TSO-CA-4 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.EDO.HOH.LEU. | ✔ | 4 | 6 | 2 | ✘ |
| 2OAI-CA-2 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 4 | 7 | 2 | ✘ |
| 2OAI-CA-3 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 4 | 7 | 2 | ✘ |
| 5D62-CA-3 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✔ |
| 5D62-CA-4 | CA | Ca²⁺ | D3L1 | ASP.LEU. | ASP.HOH.LEU. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✘ |