| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2H32-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✘ | 4 | 4 | 2 | ✔ |
| 2H32-ZN-2 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✘ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 2Z8D-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 4 | 8 | 2 | ✔ |
| 2Z8E-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 4 | 6 | 2 | ✘ |
| 2ZJS-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✔ |
| 6BVD-CA-1 | CA | Ca²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✔ |
| 1JKE-ZN-9 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 3 | ✘ |
| 1JKE-ZN-10 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 3 | ✔ |
| 1BFV-ZN-2 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✘ |
| 1BFV-ZN-3 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✘ |
| 3VQJ-NA-1 | NA | Na⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✔ |
| 3VQJ-NA-2 | NA | Na⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✔ |
| 3VRK-NA-1 | NA | Na⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✘ |
| 3VRK-NA-2 | NA | Na⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 4 | 5 | 2 | ✘ |
| 3M4C-ZN-2 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 3M4C-ZN-3 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 3M4C-ZN-4 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 3M4C-ZN-11 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✔ |
| 3M4C-ZN-12 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |
| 3M4C-ZN-13 | ZN | Zn²⁺ | D2E2 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 4 | 4 | 2 | ✘ |