| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3LCN-ZN-6 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✘ |
| 3CPM-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✔ |
| 2VES-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✔ |
| 3PN2-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 3PN2-ZN-2 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 3PN3-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✔ |
| 3PN3-ZN-3 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✘ |
| 3PN4-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 3PN4-ZN-2 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 3PN5-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 3PN5-ZN-2 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 3PN6-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✘ |
| 3PN6-ZN-3 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✘ |
| 3SEY-ZN-1 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✔ |
| 3SEY-ZN-2 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 1JOB-ZN-3 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✔ |
| 1JOB-ZN-4 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 1JOB-ZN-5 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✘ |
| 1JOB-ZN-6 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✔ |
| 2Z8D-ZN-2 | ZN | Zn²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 6 | 2 | ✘ |