| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2RAQ-CA-9 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 2RAQ-CA-10 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 2P6T-CA-2 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 2 | 2 | ✔ |
| 2P5V-CA-1 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✔ |
| 2P5V-CA-2 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✔ |
| 2P5V-CA-3 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✘ |
| 2P5V-CA-4 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 2P5V-CA-5 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 6 | 2 | ✘ |
| 2P5V-CA-6 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 6 | 2 | ✔ |
| 2P5V-CA-7 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 2P5V-CA-8 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 6 | 2 | ✘ |
| 3LAG-CA-1 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✔ |
| 3A68-CA-2 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 6 | 2 | ✘ |
| 4OJQ-CA-1 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✘ |
| 4OK3-CA-2 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✘ |
| 4OK5-CA-2 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 4 | 2 | ✘ |
| 4OK6-CA-2 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✘ |
| 4IT5-CA-2 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 5 | 2 | ✔ |
| 4IT5-CA-4 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 3 | 6 | 2 | ✘ |
| 5YL1-CA-1 | CA | Ca²⁺ | D2E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✔ | 3 | 3 | 2 | ✔ |