| Id | Element | Ion | Binding family | Amino acids or nucleotide residues names | All bound residues | Is homomer | Number of bound amino acids or nucleotide residues | Number of all bound residues | Number of coordinating chains | Representative |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6KQJ-MG-7 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | 9TY.ASP.GLU. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 6KQJ-MG-8 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | 9TY.ASP.GLU. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 6KQJ-MG-9 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | 9TY.ASP.GLU. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 6KQJ-MG-10 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | 9TY.ASP.GLU. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✔ |
| 6KQJ-MG-11 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | 9TY.ASP.GLU. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 6KQJ-MG-12 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | 9TY.ASP.GLU. | ✔ | 2 | 3 | 2 | ✘ |
| 7C8X-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✘ |
| 7C8Q-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✘ |
| 7CB4-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | GLU.HOH. | ✔ | 2 | 4 | 2 | ✘ |
| 7CBU-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✘ |
| 7CBU-MG-2 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✘ |
| 7CBR-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✔ |
| 7CBW-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✘ |
| 5IYA-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✘ | 2 | 2 | 2 | ✘ |
| 5IY6-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✘ | 2 | 2 | 2 | ✔ |
| 5IY7-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU. | ✘ | 2 | 2 | 2 | ✔ |
| 4OJU-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✔ |
| 4OJU-MG-2 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | HOH. | ✔ | 2 | 6 | 2 | ✔ |
| 5IPL-MG-1 | MG | Mg²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.G. | ✘ | 2 | 4 | 2 | ✔ |
| 7DAF-CA-1 | CA | Ca²⁺ | D1E1 | ASP.GLU. | ASP.GLU.HOH. | ✘ | 2 | 4 | 2 | ✔ |